Evaluation of a SARS-CoV-2 antigen test in the rapid diagnosis of COVID-19 suspected patients

Mehmet Soylu; Meltem Taşbakan; Ayşin Zeytinoğlu; Ayça Aydın Uysal; Gamze Şanlıdağ; Seichan Chousein Memetali; Candan Çiçek; Ayşe Deniz Gökengin; Funda Karbek Akarca; Selda Erensoy

doi:10.19161/etd.1310582

TR EN

COVID-19 şüpheli hastaların hızlı tanısında SARS-CoV-2 antijen testinin değerlendirilmesi

Öz

Amaç: SARS-CoV-2 için tanı testleri, COVID-19 pandemisinde kontrol stratejisinin önemli bir bileşenidir. SARS-CoV-2 ile enfekte olmuş bireyler için erken teşhis, izolasyon ve tedavi stratejileri kritik öneme sahiptir. Lateral akış testleri (LFA) kullanılarak antijen tespiti, ucuz ve basit olmakla birlikte hızlı sonuçlar sağlar. Bu çalışmada, COVID-19 şüpheli vakalarda hızlı antijen testinin başarısını ve ayrıca tutarsız sonuçların özelliklerini belirlemek hedeflenmiştir. Yöntemler: Ege Üniversitesi Tıp Fakültesi Hastanesi Enfeksiyon Hastalıkları ve Klinik Mikrobiyoloji Kliniği ile COVID-19 acil servisine yatırılan, 8 günden daha kısa süredir COVID-19 ilişkili semptomları olan 352 yetişkin hastadan üst solunum yolu örnekleri rutin olarak kullanılan SARS- CoV-2 RNA testi ve TOYO COVID-19 (Türklab-Türkiye)antijen testi ile değerlendirildi . Bulgular: Akut COVID-19 vakalarından şüphelenilen 352 yetişkin hasta arasında 164 kadın ve 184 erkek mevcuttu. Hastaların yaşları 18 ile 88 arasında olup ortanca yaş 41.25 idi. Rutin olarak çalışılan SARS-CoV-2 RNA PCR testi hastaların 127'sinde (%37.1) pozitif, 225'inde (%63.9) negatif olarak saptandı. Bu hastaların nazal sürüntü örneklerinin 116'sında (%33.0) COVID-19 antijen testi pozitif ve 236'sında (%67.0) negatif saptandı. COVID-19 hızlı antijen testinin duyarlılığı ve özgüllüğü sırasıyla %89.7 ve %99 olarak saptandı. Sonuç: Sağlık personeli için kullanımı kolay ve hızlı bir SARS-CoV-2 antijen testi, semptomatik hastalar veya çok sayıda virüs saçan asemptomatik bireyler için acil izolasyon kararı vermede yardımcı olabilir. Bu çalışmada, düşük viral yükler, yanlış negatif antijen testi sonuçlarıyla daha yakın olarak ilişkilendirilmiştir.

Anahtar Kelimeler

Evaluation of a SARS-CoV-2 antigen test in the rapid diagnosis of COVID-19 suspected patients

Abstract

Aim: Diagnostic testing for SARS-CoV-2 is an important component of the overall COVID-19 prevention and control strategy. Antigen detection using lateral flow assay (LFA) platforms can be performed at the point-of-care, providing quick results while being inexpensive and simple to perform. The current study sought to determine the success of a rapid antigen test in COVID-19 suspected cases, as well as the characteristics of discrepant results. Materials and Methods: Upper respiratory samples from 352 adult patients suspected of acute COVID-19 cases with related symptoms for <8 days, who were admitted to Ege University Faculty of Medicine Department of Infectious Diseases and Department of Emergency Unit were tested routinely for SARS-CoV-2 RNA and evaluated with TOYO COVID-19 antigen test (Türklab-Turkey). Results: There were 164 females and 184 males among the 352 adult patients (>18 years old) suspected of acute COVID-19 cases. The patients ranged in age from 18 to 88 years old, with a median age of 41.25 years. A routine test for SARS-CoV-2 RNA found positive results in 127 (37.1%) of the patients and negative results in 225 (63.9%). The COVID-19 Ag test was positive in 116(33%) of these patients' nasal swab samples and negative in 236 (67%). The sensitivity and specificity of the COVID-19 Ag test was 89.7% and 99%, respectively. Conclusion: A rapid SARS-CoV-2 antigen test, which will be tested easily and supervised by medical personnel, could help decide for immediate isolation for patients or asymptomatic individuals that are shedding large number of viruses. In this study, lower viral loads can be strongly linked to the false negative antigen test results.

Keywords

Destekleyen Kurum

Türklab Medical Devices Company supported this study by providing test kits free of charge.

Kaynakça

Coutard B, Valle C, de Lamballerie X, Canard B, Seidah NG, Decroly E. The spike glycoprotein of the new coronavirus 2019-nCoV contains a furin-like cleavage site absent in CoV of the same clade. Antiviral Res 2020;176:104742.
Kurekci Y, Gumus HH, Ezirmik H. Evaluation of clinical Symptoms, laboratory Findings, radiological characteristics and treatments of adult patients with severe COVID-19 pneumonia. Mediterr J Infect Microb Antimicrob 2021;10:64.
Vandenberg O, Martiny D, Rochas O, van Belkum A, Kozlakidis Z. Considerations for diagnostic COVID-19 tests. Nat Rev Microbiol 2021;19(3):171–3.
World Health Organisation Antigen-detection in the diagnosis of SARS-CoV-2 infection [updated 6 October 2021]; [cited 23 June 2022]. Available from: www.who.int/publications/i/item/antigen-detection-in-thediagnosis- of-sars-cov-2infection-using-rapid-immunoassays
Çiçek C, Soylu M, Özarslan MA, et al. Characteristics of Laboratory-Confirmed Positive Cases in the First Year of the COVID-19 Pandemic in a University Hospital. FLORA 2021;26(3):446–59.
Corman VM, Haage VC, Bleicker T, et al. Comparison of seven commercial SARS-CoV-2 rapid point-of-care antigen tests: a single-centre laboratory evaluation study. Lancet Microbe 2021;2(7):e311–9.
He X, Lau EHY, Wu P, et al. Temporal dynamics in viral shedding and transmissibility of COVID-19. Nat Med 2020;26(5):672–5.
Wölfel R, Corman VM, Guggemos W, et al. Virological assessment of hospitalized patients with COVID-2019. Nature 2020;581(7809):465–9.

Ayrıntılar

Birincil Dil

İngilizce

Konular

Tıbbi Mikrobiyoloji (Diğer)

Bölüm

Araştırma Makalesi

Yazarlar

Mehmet Soylu ^*
0000-0002-9145-1506
Türkiye

Meltem Taşbakan
0000-0002-4689-720X
Türkiye

Ayşin Zeytinoğlu
0000-0003-4174-9539
Kuzey Kıbrıs Türk Cumhuriyeti

Ayça Aydın Uysal
0000-0003-0192-7126
Türkiye

Gamze Şanlıdağ
0000-0002-9317-854X
Türkiye

Seichan Chousein Memetali
0000-0003-3167-2988
Türkiye

Candan Çiçek
0000-0002-3486-8305
Türkiye

Ayşe Deniz Gökengin
0000-0003-0704-2302
Türkiye

Funda Karbek Akarca
0000-0003-2455-8044
Türkiye

Selda Erensoy
0000-0002-7052-8359
Türkiye

Yayımlanma Tarihi

12 Haziran 2023

Gönderilme Tarihi

23 Haziran 2022

Kabul Tarihi

8 Ekim 2022

Yayımlandığı Sayı

Yıl 1970 Cilt: 62 Sayı: 2

DOI

https://doi.org/10.19161/etd.1310582

IZ

https://izlik.org/JA43XD72KC

Kaynak Göster

RIS / Bibtex

Vancouver

1.Mehmet Soylu, Meltem Taşbakan, Ayşin Zeytinoğlu, Ayça Aydın Uysal, Gamze Şanlıdağ, Seichan Chousein Memetali, Candan Çiçek, Ayşe Deniz Gökengin, Funda Karbek Akarca, Selda Erensoy. Evaluation of a SARS-CoV-2 antigen test in the rapid diagnosis of COVID-19 suspected patients. ETD. 01 Haziran 2023;62(2):234-9. doi:10.19161/etd.1310582