Amaç: Coronavirüs hastalığı 2019 (COVID-19), şiddetli akut solunum sendromu 2 virüsünün (SARS-CoV-2) neden olduğu ve küresel olarak yayıldığı bir hastalıktır. Cinsiyet ve yaş, ciddi COVİD-19 için risk faktörleri olarak belirlenmiştir. Ancak bu faktörler hastalık riski üzerindeki etkileri tam olarak açıklamamaktadır. Araştırmacılara göre, birden fazla gendeki tek nükleotid polimorfizmleri (SNP'ler), COVID-19'un şiddetini etkileyebilir. Viral hastalıkların ilerlemesi hastanın doğuştan gelen bağışıklığının özelliklerine bağlıdır. Doğuştan gelen bağışıklık sisteminin etkinliği, TLR, CCR5 ve RIG-I genlerindeki SNP'ler dahil olmak üzere hastanın genetik faktörlerine bağlıdır. Bu çalışmada, COVID-19 hastalarının SNP'lerindeki alel ve genotip sıklığının yaş ve cinsiyet ile ilişkisini araştırdık.
Gereç ve Yöntem: Çalışmamıza orta şiddette COVİD-19 hastası 200 hasta dahil edildi. TLR3 (rs3775291, rs3775290, rs5743305), TLR7 (rs179008), TLR8 (rs3764880), RIG-I (rs12006123) ve CCR5'in (rs1799987) tek nükleotid polimorfizmleri (SNP) incelenmiştir. SNP'ler, kısıtlama fragmanı uzunluğu polimeraz zincir reaksiyonu (RFLP-PCR) yöntemleriyle belirlendi.
Bulgular: COVID-19 hastalarında allel ve genotip frekansları ile yaş, cinsiyet gibi bazı parametreler arasındaki ilişki açısından değerlendirilen hastaları inceledik. Sonuçlarımızda TLR3 rs5743305 AA genotip frekansı (p=0,03) ve TLR7 rs179008 AA genotip frekansı (p=0,03) yaş ve cinsiyet açısından anlamlı bulundu.
Sonuç: Bu SNP verileri, COVID-19 hastaları için kişiselleştirilmiş farmakolojik tedaviyi planlamak amacıyla hastalık riskine karşı değerlendirilebilir. Bu çalışmadan elde edilecek bulgular genom çapında ilişkilendirme çalışmaları (GWAS) için faydalı olacaktır.
İKÇÜ BAP
2020-COV-TIPF-0002
Aim: The coronavirus disease 2019 (COVID-19) was caused by severe acute respiratory syndrome 2 virus (SARS-CoV-2), has spread globally. Gender and age have been established as risk factors for severe COVID-19. However, these factors do not fully explain the effects on disease risk. According to researchers, single nucleotide polymorphisms (SNPs) on multiple genes could affect the severity of COVID-19. The progression of viral diseases depends on the characteristics of the patient's innate immunity. The effectiveness of the innate immune system depends on the patient's genetic factors, including SNPs in the TLR, CCR5, and RIG-I genes.
In this study, we researched the association of allele and genotype frequency in SNPs of COVID-19 patients with age and gender.
Materials and Methods: In our study, 200 patients with moderate COVID-19 were included. Single nucleotide polymorphisms (SNP) of TLR3 (rs3775291, rs3775290, rs5743305), TLR7 (rs179008), TLR8 (rs3764880), RIG-I (rs12006123), and CCR5 (rs1799987) were studied. SNPs were determined by restriction fragment length polymerase chain reaction (RFLP-PCR) methods.
Results: In the COVID-19 patients, we examined the patients were evaluated in terms of allele and genotype frequencies and the association between some parameters like age, and gender. In our results, TLR3 rs5743305 AA genotype frequency (p=0.03) and TLR7 rs179008 AA genotype frequency (p=0.03) were found to be significant in terms of age and gender.
Conclusions: These SNP data is assessed against disease risk to plan personalized pharmacological therapy for COVID-19 patients.The findings from this study will be useful for genome-wide association studies (GWAS).
2020-COV-TIPF-0002
Birincil Dil | İngilizce |
---|---|
Konular | Temel İmmünoloji |
Bölüm | Araştırma Makaleleri |
Yazarlar | |
Proje Numarası | 2020-COV-TIPF-0002 |
Yayımlanma Tarihi | 10 Haziran 2024 |
Gönderilme Tarihi | 7 Eylül 2023 |
Yayımlandığı Sayı | Yıl 2024Cilt: 63 Sayı: 2 |