The evaluation of the distribution and antimicrobial susceptibility profile of strains isolated from urine specimens at a university hospital

Aim: Urinary tract infections (UTI) are first in community and hospital acquired infections. Anatomic localisation, predisposing factors and gender are effective factors in infection. Therefore young women and elderly patients particularly have more risk. The most common isolated bacteria is E.coli. Increasing resistance is reported in microorganisms causing infection. Regional antimicrobial resistance data are important in empirical treatment due to variations in resistance among other regions. The aim of our study was to evaluate the strains and their antimicrobial susceptibility pattern isolated from urine samples at our recently opened University Hospital Microbiology Laboratory. Materials and Methods: Urine samples sent from various departments to the University Hospital Microbiology Laboratory between 17.10.2011 – 30.08.2012 were included in the study. The identification and antimicrobial susceptibility of the isolates were studied by the automatized Vitek version 2.0 system (Biomerieux, France). Results: 348 strains out of 937 urine samples were taken into the study. The most frequently isolated strain was E.coli (52%). All members of Enterobacteriaceae were susceptible to carbapenems. The most susceptible antibiotics were carbapenems (100%) and amikacin (88.9%). The least susceptible ones were ampicillin (34.2%) and trimethoprim-sulfamethoxazole (51%). E.coli strains had 38.6% ESBL positivity. Conclusion: There is growing resistance in most of the microorganisms causing urinary tract infections. The resistance profile in urinary tract infections varies in different centers and for this reason, this data is important for our recently opened university hospital.

Amaç: İdrar yolu enfeksiyonları (İYE) toplum ve hastane kökenli enfeksiyonlar içinde ilk sırada yer almaktadır. Anatomik yer, kolaylaştırıcı faktörlerin varlığı ve cinsiyet bu enfeksiyonların gelişiminde etkili faktörlerdir. Bu nedenle özellikle genç kadın ve yaşlı hastalar daha fazla risk altındadır. Bu enfeksiyonlarda en sık izole edilen bakteri E.coli‘dir. Yapılan çalışmalarda bu enfeksiyonlara neden olan mikroorganizmalara karşı artan oranlarda direnç bildirilmektedir. Bölgesel ve merkezler arası değişkenlikten dolayı ampirik tedavinin de sık uygulandığı bu enfeksiyonları oluşturan suşların ve antibiyotik direncinin bölgesel verilerinin önemi artmıştır. Bu amaçla çalışmamızda yeni kurulan üniversite hastanemiz Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen idrar örneklerinden izole edilen suşları ve antimikrobiyal duyarlılık paternlerinin değerlendirmesi amaçlandı. Gereç ve Yöntem: 17 Ekim 2011-30 Ağustos 2012 tarihleri arasında hastanemiz Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na çeşitli birimlerden gönderilen idrar yolu örnekleri çalışmaya dahil edildi. Üreyen izolatların identifikasyonu ve antibiyotik duyarlılıkları otomatize Vitek version 2.0 sistemi ile çalışıldı. Bulgular: Çalışmamıza Mikrobiyoloji Laboratuvarı'na gönderilen 937 idrar örneği arasından üreyen 348 izolat (%37,1) dahil edildi. Bu suşlar arasında en fazla izole edilen suş %52 oranıyla E.coli olarak görüldü. Enterobacteriaceae üyelerinin tümü karbapeneme duyarlı bulundu. E.coli'ye karşı en duyarlı antibiyotikler karbapenem (%100) ve amikasin (%88.9); en az duyarlı antibiyotikler ise ampisilin (%34.2) ve trimetoprim/sülfametoksazol (%51) olarak bulundu. E.coli izolatlarında %38.6 oranında GSBL pozitifliği gözlendi. Sonuç: İdrar yolu enfeksiyonlarına yol açan mikroorganizmaların birçoğunda antibiyotiklere karşı artan oranlarda direnç geliştiği görülmektedir. İdrar yolu enfeksiyon etkenlerinin antibiyotik direnç oranları merkezlere göre farklılıklar göstermesi nedeniyle yeni kurulan hastanemiz için bu çalışmanın önemli olduğunu düşünmekteyiz.